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Mailly se situe au sud du brionnais , à l'extrême sud de la bourgogne . la commune se répartit sur trois collines - corbey, le bourg et les chavannes - séparées respectivement par le ruisseau du pré de la caille, et le ruisseau des riollets qui est un affluent direct de la loire . le sous-sol est composé d'argiles, de marnes et de calcaires